Il semblerait que le PSG-Rennes du 28 mai dernier où il a remplacé Pauleta à une minute de la fin de la rencontre soit le dernier match de Danijel Ljuboja sous les couleurs parisiennes.
Après une très bonne deuzième partie de saison 2003/2004 où il inscrivit 5 buts en L1 avec le club de la capitale, le serbo-monténégrain a vécu cette saison la pire de sa carrière avec un total de 2 buts en championnat et 1 but en Coupe de France.
Alors qu'il a annoncé récemment son envie de rester au PSG "J'aime trop ce club et ses supporters", Jean-Michel Moutier a déclaré à l'AFP que le club parisien souhaite transférer Ljuboja et que plusieurs offres sont parvenus au club mais elles ne plaisaient pas à ce dernier.